samedi 15 décembre 2012

L'évolution des animaux, partie 3 : Scission d'un groupe uni

On reprend là où en en était avant, avec nos... heu... vers. Tout va bien. Pour l'instant, tout les "bilatériens" sont des vers et tous les vers sont des "bilatériens". C'est un groupe uni. Les embryons des "bilatériens" primitifs avaient à peu près tous le même développement. Mais tout cela va changer.


La Guerre des Embryons


À ce moment-là, nous étions à l'époque de l’édiacarien. Deux bilatériens vont naître, mais porteront des mutations décisives pour leur évolution. Chez l'embryon de l'un des deux, le blastopore deviendra l'anus. C'est l'ancêtre des deutérostomiens. Chez l'embryon de l'autre, le blastopore deviendra la bouche. C'est l'ancêtre des protostomiens.

D'autres différences vont apparaître par la suite, comme la position du coelome à la gastrulation (mais qui se débrouillera toujours pour se mettre près de la bouche!).

On peut remarquer qu'au début de l'article, le mot "bilatérien" a été mis entre guillemets. En effet, les animaux en question n'étaient pas vraiment des bilatériens, mais des animaux à symétrie bilatérale. Quelle différence? En réalité, le groupe des bilatériens est "basé sur un nœud", ce qui veut dire (nous y reviendrons plus tard) que ce clade comporte les deutérostomiens, les protostomiens, leu ancêtre commun, et tous ses descendants. Et rien d'autre. Pas de bilatériens primitifs, cela n'existe pas (sauf si ce sont déjà des deutérostomiens ou des protostomiens). Par contre, les deutérostomiens sont "basés sur une branche", car ils comportent le moineau domestique et tout ce qui est plus proche de lui que d'un protostomien.

À suivre (et à améliorer)...

vendredi 19 octobre 2012

L'évolution des animaux, partie 2 : Une question de symétrie

Bon, on est (assez) bien avancés avec nos quoi déjà? Ah oui, avec nos épithéliozoaires primitifs, mais le problème est qu'ils ne ressemblent à rien. Ils sont asymétriques. Ni symétriques radialement, ni bilatéralement. Ils ressemblent au Trichoplax, mais avec des tissus. Pour expliquer ce qu'est une symétrie, en voici quelques exemples. Le premier est une méduse, le deuxième est un ver plat turbellarié :
Cnidaire, symétrie radiaire
Ver, symétrie bilatérienne

To be radiaire or not to be

Pour les premiers eumétazoaires de l’édiacarien, on est au stade de symétrie radiaire. Cette symétrie est apparue en même temps que les organes des animaux, car on a besoin d'un plan d'organisation pour placer tous ces organes. En même temps, si on ne pouvait pas organiser cela, il n'y aurait pas d'organes, et au final, les animaux ne survivraient pas. Il fallait une symétrie. Et on en a une!
Mais il y a un autre avantage à avoir une symétrie. C'est d'avoir une ingestion centralisée dans une bouche unique, et non pas dans des dizaines de milliers de porocytes, choanocytes, machin-chose-ocytes, etc. Grâce à cela, les eumétazoaires sont très près de leur explosion radiative. Mais ils n'y sont pas encore. En effet, il leur manque quelque chose pour évacuer les déchets, l'anus.

Solution à double tranchant

Oui, vous avez bien lu, une méduse ou un cténophore n'a pas d'anus. Mais il doit quand même évacuer ses déchets. Pour faire moins court, les bilatériens possèdent ça à l'opposé de la bouche (sauf pour les chordés, mais on reverra ça plus tard). Il faut un anus. C'est une des caractéristiques des bilatériens. Les autres sont :
  • Symétrie bilatérienne
  • Archentéron
  • Mésoderme
  • Gastrulation
  • Coelome (qui peut être perdu dans l'évolution)
Oui, ça fait beaucoup. Mais on peut déjà presque faire d'une pierre deux coups. En effet, l'archentéron est le tuyau reliant la bouche à l'anus. L'un entraîne l'autre, en creusant un trou (ou en refermant (en partie) la couche de cellules initiales chez les deutérostomiens. Voilà, ce n'est pas si difficile que ça... On passe au suivant : Le mésoderme, qui est une couche de cellules présente entre l'exoderme et l'endoderme. C'est trop simple, il suffit de prendre une des couches de cellules déjà existantes, de la dédoubler, puis de la modifier légèrement : Et voilà un mésoderme! Et tout cela pendant... la gastrulation, moment où se forme l'archentéron. Il ne reste plus que le coelome et la symétrie bilatérienne. Pour le coelome, je vous laisse deviner. Pour la symétrie bilatérienne, le débat est en cours.

À suivre...

samedi 8 septembre 2012

L'évolution des animaux, partie 1 : Les éponges n'épongent rien

Les animaux. Ils forment le règne le plus développé de toute la biodiversité. Mais savez-vous qu'au tout début, ils n'étaient pas des poissons, ni des vers, ni encore des cœlentérés. C'étaient... ou plutôt ce n'étaient pas des épithéliozoaires, c'est-à dire des animaux qui possèdent une lame basale. C'étaient des éponges. Oui, ces petites éponges ressemblant à ceci:
Source de l'image : Eponge à canons

Des amas de cellules


Enfin... ceci est quand même une éponge assez évoluée. Les ancêtres des animaux ressemblaient plutôt des cellules collées les unes aux autres, comme ceci:
Source de l'image : Cellules agglomérées
Ensuite, ces masses informes vivant il y a 900 millions d'années ont évoluées et ont donné des masses de cellules ressemblant à des sphères avec un grand vide au milieu. Contrairement aux éponges ultra-primitives, ce n'étaient pas plusieurs êtres vivants vivant en colonie mais bel et bien un seul être.
Ces sphères vivant accrochées aux sol ne possédaient qu'un seul type de cellules : Les archaeocytes. Ces étranges cellules possèdent la capacité de se spécialiser en... tout! Oui, tout. Choanocytes, ovocytes, porocytes, amibocytes, truc-ocytes, bidules-ocytes... Mais ces cellules ne daignèrent pas se spécialiser.
Mais, à un endroit quelconque, sur un sol quelconque, dans une sphère quelconque, quelques cellules mutèrent accidentellement. Elles devinrent des ovocytes, cellules spécialisées dans la reproduction sexuée.

Ce n'était pas encore un animal. Ces derniers devaient se nourrir, et avaient donc besoin de 3 types supplémentaires de cellules : Les porocytes, pour envoyer les proies dans le corps de l'éponge, les choanocytes, qui utilisent leurs flagelles pour faire circuler l'eau dans le corps de l'éponge et digérer les plus petites, et les amibocytes, pour phagocyter les plus grosses. Enfin des éponges. En ajoutant quelques spicules, de la mésoglée et un ectoderme, cela donnait une splendide éponge.

Enfin des eumétazoaires


Il existe une différence de taille entre une éponge et un eumétazoaire. Les eumétazoaires signifient "vrais animaux". Comme si les éponges et Trichoplax en étaient des... faux. Les eumétazoaires sont des animaux possédant un système nerveux et des tissus.
Une forme intermédiaire est ceci :
Qu'est-ce que c'est ? Source de l'image : Animal-feuille

Oui, cette galette aplatie. À quoi cela sert-il ? Certains scientifiques le classent parmi un nouveau règne, les Vendozoaires. D'autres les classent parmi les eumétazoaires, d'autres encore y voient une forme intermédiaire entre les éponges et les eumétazoaires...

À suivre...

mercredi 22 août 2012

Cellule+Noyau=Eucaryote

Qu'est-ce qu'un eucaryote?


Les eucaryotes sont les organismes possédant un noyau cellulaire. C'est-à-dire que leur ADN (molécule qui dit à peu près à quoi va ressembler son possesseur) est contenu dans une coque, ou dans un noyau si vous préférez, qui l'empêche de se disperser partout dans la cellule.

Ok, mais qui est un eucaryote? Les animaux sont des eucaryotes, les plantes en sont, les champignons aussi,  et d'autres groupes minuscules. Cependant, ni les bactéries ni les archées n'en sont.

La cellule eucaryote possède également des mitochondries, sortes de machines qui transforment l'ADN en ARN (une autre molécule bizarre qui permet de fabriquer des protéines).

Comment classer les Eucaryotes : Une histoire de flagelles


Voici la liste de tous les groupes d'Eucaryotes:
  • Animaux
  • Plantes
  • Champignons
  • Chromistes
  • Alvéolés
  • Rhizaires
  • Creusés
  • Amibes
  • Choanoflagellés
  • Mésomycétozoaires (ouf!) ou DRIP
  • Apusozoaires
Vous ne devez pas tous les connaître, juste les 3 premiers, que vous connaissez déjà.

Pour les classer, remarquons déjà que les animaux, champignons, DRIP, amibes et choanoflagellés possèdent une seule flagelle. Ils forment le groupe des Unicontes. Tous sauf les amibes possèdent une flagelle servant à la propulsion. Ce sont donc des Opisthocontes.

Quant aux autres, ils possèdent deux flagelles : Ils appartiennent au groupe des Bicontes.

Chez les choanoflagellés et chez les animaux primitifs (éponges), une structure en forme de collerette entoure la flagelle. Regroupons-les donc dans le groupe des Choanobiontes.

L'arbre phylogénétique a l'air parfait.

De nouveaux venus


C'était sans compter sur l'arrivée de nouveaux venus, qui vont bouleverser ce classement. D'abord, Collodictyon fut découvert en 1865, ainsi que les Nucléariides la même année, puis les  Filastériens en 2008.

Il a fallu leur créer de nouveaux groupes. Collodictyon n'est ni un uniconte, ni un biconte : il possède 4 flagelles. Cependant, on pense qu'il est légèrement plus proche des bicontes.

Ensuite, les nucléariides possèdent une structure étrange. En voici une zolie image:
Heureusement, les scientifiques y ont vu une flagelle de propulsion. Ce sont donc des opisthocontes, n'est-ce pas?
Ils possèdent des éléments qui tendent à prouver qu'ils sont plus proche des champignons que d'autre chose. Il faut donc créer deux groupes dans les opisthocontes : d'abord un comportant tout ça. Nommons-le le groupe des Holomycètes. Cela signifie "tous les champignons", même si  les nucléariides n'en sont pas.
Le deuxième groupe comprendra le reste. On pourra le nommer "Holozoaires".

Enfin, les filastériens posent aussi problème. Ils appartiennent aussi au groupe des Opisthoconte, c'est sûr. Cependant, il faut les situer dans les opisthocontes. Comme les choanobiontes, ils possèdent des filaments vermiformes avec un noyau bizarre. Tout cela fait donc partie du groupe des Filozoaires.

Et voilà, le classement est terminé!

Introduction

Présentation


Ce blog n'est pas un blog portant sur la biologie. C'est Le blog portant sur la biologie.

Créé le 22/08/12, il a pour fin, en plus de créer des articles sur (quasiment) tous les groupes d'espèces, en plus de (re)classer toutes les espèces, en plus d'expliquer tous les mécanismes évolutifs, de vous permettre de tout apprendre sur ces sciences que sont la taxonomie, la phylogénétique, la systématique, l'évo-dévo et les autres.

Pourquoi les reptiles n'existent pas


En réalité, chaque reptile existe en lui même. Cependant, le groupe des reptiles ne peut pas exister. En effet, il comprend tous les amniotes (animaux pondant un oeuf à coquille) sauf les oiseaux et les mammifères. Pour empêcher des "bogues" comme celui-là, il faudrait éclater le groupe des reptiles en :
  • Caséasauriens
  • Varanopidés
  • Ophiacodontidés
  • Édaphosauridés
  • Haptodus
  • Paleohatteria
  • etc.
Cela fait beaucoup...

Sinon, l'autre possibilité est de créer un groupe, à la place des reptiles, comportant en plus les oiseaux et les mammifères. C'est le groupe des amniotes. Et d'oublier le groupe des reptiles.

L'équipe des Justiciers de la Biologie

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    • Ne souhaite pas en dire plus sur lui.
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